战区88街机版和SFC基本就是两个游戏，街机虽然有地图但无法自由选关，战斗机也是固定的不能更换，三个角色的战机不同。
而SFC版大量加入RPG要素，三个角色的初始战机相同但人物能力不同，游戏里不仅可以购买附属武器还可以更换战机。同时可以自由选关，某些关卡如果长时间不打，敌人也会攻击我方基地，另外很多关卡的也和街机不同，也加入了不少纯粹赚钱的奖励关。