我是东京往返，票价便宜，所以东京北海道的行程其实是可以函馆进札幌出的，如果你是札幌往返，那往返函馆确实麻烦，我研究了下，一天来回太累，两天的话又需要函馆住一晚上，换酒店太折腾。
当然我的行程里包括了登别温泉街住宿几天，所以不太一样，您如果想去函馆，我看了下也可以走函馆-洞爷湖-登别-札幌的路线，旭川从札幌一日往返可以做到，不建议住，小樽就更近了。